研究火熱的“銅死亡”
2022年3月17日,美國(guó)哈佛大學(xué)和麻省理工學(xué)院布羅德研究所的TODD R. GOLUB團(tuán)隊(duì)合作,在頂級(jí)學(xué)術(shù)期刊Science發(fā)表題為“Copper induces cell death by targeting lipoylated TCA cycle proteins”的研究性論文,作者發(fā)現(xiàn):細(xì)胞體內(nèi)依賴于銅離子且受到調(diào)控的新的細(xì)胞死亡方式--“銅死亡”(Cuprotosis)。
在過去約30年中,細(xì)胞死亡研究已經(jīng)走了很長(zhǎng)一段路,除了揭示基本生物學(xué)過程的機(jī)制外,它還帶來了針對(duì)癌癥和其他疾?。ɡ缒承┳陨砻庖咝圆±韺W(xué)或傳染?。┑男炉煼ǎ渲屑?xì)胞凋亡、細(xì)胞焦亡、細(xì)胞壞死和鐵死亡,是近年來研究得最為廣泛的幾種形式。(點(diǎn)擊查看相關(guān)“細(xì)胞生物學(xué)”專題文章),這里我們了解下最新報(bào)道的“銅死亡”。
1. “銅死亡”
TODD R研究團(tuán)隊(duì)揭示的“銅死亡”是一種全新的、受調(diào)控的細(xì)胞死亡方式。銅離子直接結(jié)合三羧酸(TCA)循環(huán)中的硫辛?;M分,導(dǎo)致硫辛?;鞍椎漠惓>奂?,F(xiàn)e-S簇蛋白表達(dá)下降,從而引起蛋白毒性應(yīng)激反應(yīng)并導(dǎo)致細(xì)胞死亡。
這意味著可以針對(duì)相關(guān)分子,制定出一套更有效的銅離子載體治療方案,特別是針對(duì)FDX1、硫辛?;礁?,依賴線粒體呼吸的腫瘤類型。因此,“銅死亡”作為最新提出的一種細(xì)胞死亡機(jī)制,引起學(xué)術(shù)界的振奮!
2.“銅死亡”調(diào)節(jié)機(jī)制
通過TODD R團(tuán)隊(duì)的研究結(jié)果部分,我們可以了解到銅離子載體導(dǎo)致細(xì)胞死亡的機(jī)制,具體結(jié)果分析過程如下:
1)銅離子載體誘導(dǎo)的細(xì)胞死亡是新型的細(xì)胞死亡
首先研究團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn),銅離子載體均能殺傷細(xì)胞,且使用銅離子載體Elesclomol,可調(diào)控銅介導(dǎo)的細(xì)胞死亡。那這種死亡方式,是否區(qū)別于已知的死亡方式(細(xì)胞凋亡、細(xì)胞壞死、鐵死亡)?為了進(jìn)一步驗(yàn)證,團(tuán)隊(duì)通過敲除凋亡關(guān)鍵效應(yīng)因子Bax和BAK1,結(jié)果發(fā)現(xiàn)未能阻止銅離子載體誘導(dǎo)的細(xì)胞死亡,說明其細(xì)胞死亡機(jī)制明顯不同于已知的細(xì)胞死亡途徑。這些數(shù)據(jù)證實(shí),銅離子載體誘導(dǎo)的細(xì)胞死亡是一種全新的細(xì)胞死亡形式。
圖1. 銅離子載體誘導(dǎo)的細(xì)胞死亡是新型的細(xì)胞死亡 [1]
2)線粒體呼吸調(diào)節(jié)銅離子載體誘導(dǎo)的細(xì)胞死亡
緊接著,TODD R團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn)線粒體呼吸在這種死亡機(jī)制中發(fā)揮關(guān)鍵作用。實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)表明,當(dāng)細(xì)胞依賴于線粒體呼吸時(shí),其對(duì)銅離子載體的敏感性比進(jìn)行糖酵解細(xì)胞高近1千倍;使用線粒體抗氧化劑、脂肪酸以及線粒體功能抑制劑處理細(xì)胞,會(huì)顯著影響細(xì)胞對(duì)銅離子載體的敏感性。
此外,線粒體解聚物FCCP對(duì)銅離子載體誘導(dǎo)的細(xì)胞死亡沒有影響;隨后團(tuán)隊(duì)檢測(cè)了細(xì)胞不同類型的缺氧刺激,與銅離子載體處理對(duì)細(xì)胞耗氧率(OCR)的影響,數(shù)據(jù)表明,銅不會(huì)直接針對(duì)電子傳遞鏈(ETC),而是只在三羧酸(TCA)循環(huán)中發(fā)揮作用。這些論證表明,銅誘導(dǎo)細(xì)胞死亡所必需的是線粒體呼吸。
圖2. 線粒體呼吸調(diào)節(jié)銅離子載體誘導(dǎo)的細(xì)胞死亡 [1]
3)FDX1與蛋白硫辛酰化是銅離子載體誘導(dǎo)細(xì)胞死亡的關(guān)鍵介質(zhì)
為進(jìn)一步明確細(xì)胞死亡的代謝路徑,研究團(tuán)隊(duì)使用了全基因組CRISPR-Cas9功能缺失篩選,并采用不同結(jié)構(gòu)的銅離子載體進(jìn)行處理,以提高篩選的普遍性。團(tuán)隊(duì)對(duì)3千種代謝酶進(jìn)行獨(dú)立的敲除篩選。
從以上的篩選中,他們找到了七個(gè)正調(diào)控基因(FDX1、LIAS、LIPT1、DLD、DLAT、PDHA1和PDHB)以及三個(gè)負(fù)調(diào)控基因(MTF1、GLS和CDKN2A),其中鐵氧還蛋白 1基因(ferredoxin 1,F(xiàn)DX1)和蛋白質(zhì)硫辛?;≒rotein lipoylation)是銅離子載體誘導(dǎo)細(xì)胞死亡的關(guān)鍵調(diào)控因子。通過個(gè)別基因敲除研究,缺失FDX1和硫辛酸合酶基因(lipoic acid synthase,LIAS)可增強(qiáng)對(duì)銅誘導(dǎo)的細(xì)胞死亡的抵抗力,進(jìn)一步說明FDX1和蛋白硫辛?;c銅離子載體誘導(dǎo)的細(xì)胞死亡之間的功能聯(lián)系。這些研究表明,F(xiàn)DX1與蛋白硫辛?;倾~離子載體誘導(dǎo)細(xì)胞死亡的關(guān)鍵介質(zhì)。
圖3. FDX1與蛋白硫辛?;倾~離子載體誘導(dǎo)細(xì)胞死亡的關(guān)鍵介質(zhì) [1]
4)FDX1是蛋白硫辛酰化的上游調(diào)控因子
進(jìn)一步的,研究團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn),敲除FDX1或硫辛?;嚓P(guān)酶均可以保護(hù)細(xì)胞免遭銅毒性,因此,他們提出猜想,F(xiàn)DX1可否為蛋白質(zhì)硫辛?;纳嫌握{(diào)節(jié)因子?通過癌癥依賴性圖譜(Cancer Dependency Map)等公共數(shù)據(jù)庫(kù),他們發(fā)現(xiàn)FDX1和硫辛?;嚓P(guān)酶與細(xì)胞存活高度相關(guān)。
隨后,他們對(duì)208例人類腫瘤標(biāo)本進(jìn)行FDX1和硫辛酸途徑蛋白的免疫組化(IHC)染色分析,結(jié)果顯示FDX1和硫辛?;鞍椎谋磉_(dá)高度相關(guān);WB實(shí)驗(yàn)又進(jìn)一步確認(rèn)了FDX1的敲除會(huì)導(dǎo)致二氫硫辛酰胺轉(zhuǎn)乙?;富颍―ihydrolipoamide S-Acetyltransferase,DLAT)和二氫硫辛酰胺S-琥珀酰轉(zhuǎn)移酶(DLST,Dihydrolipoamide S-Succinyltransferase)的蛋白硫辛酰化缺失;通過代謝物分析發(fā)現(xiàn),F(xiàn)DX1的缺失會(huì)導(dǎo)致丙酮酸和α-酮戊二酸的積累,琥珀酸的消耗,以及LIAS的關(guān)鍵底物S-腺苷甲硫氨酸(SAM)的積累。以上數(shù)據(jù)證實(shí),F(xiàn)DX1參與調(diào)節(jié)蛋白的硫辛?;^程。
圖4. FDX1是蛋白硫辛?;纳嫌握{(diào)控因子 [1]
5)銅直接結(jié)合硫辛?;疍LAT并誘導(dǎo)其寡聚化
通過前面的實(shí)驗(yàn),作者建立了銅死亡和蛋白質(zhì)脂酰化之間的聯(lián)系,但只是間接證實(shí)FDX1和硫辛?;牡鞍自阢~死亡中的重要性,沒有建立直接的機(jī)制聯(lián)系。那么,銅是否直接與脂?;鞍踪|(zhì)結(jié)合呢?
為此,研究團(tuán)隊(duì)在FDX1敲除細(xì)胞與正常細(xì)胞的裂解液中純化出DLAT和DLST兩種蛋白,結(jié)果發(fā)現(xiàn)正常細(xì)胞中的DLAT和Lip-DLST(硫辛酰化狀態(tài)),會(huì)直接與銅離子結(jié)合,但不與鈷或鎳樹脂結(jié)合。而FDX1敲除細(xì)胞中的DLAT和DLST(去硫辛?;癄顟B(tài))則不與銅結(jié)合,表明蛋白的硫辛?;揎?,是直接結(jié)合銅的必要條件。
此外,對(duì)Elesclomol敏感細(xì)胞的處理會(huì)增加DLAT寡聚體的水平,而對(duì)Elesclomol不敏感細(xì)胞系或FDX1敲除處理,只有在Elesclomol高濃度下才能導(dǎo)致DLAT寡聚。通過質(zhì)譜分析進(jìn)一步發(fā)現(xiàn),銅離子載體處理還可導(dǎo)致Fe-S簇蛋白的水平降低。以上數(shù)據(jù)表明,銅直接結(jié)合硫辛?;疍LAT并誘導(dǎo)其寡聚化。
圖5. 銅直接結(jié)合硫辛?;疍LAT并誘導(dǎo)其寡聚化 [1]
6)銅過量導(dǎo)致的細(xì)胞死亡機(jī)制與銅離子載體誘導(dǎo)的細(xì)胞死亡機(jī)制是同一種機(jī)制
研究到這兒,通過以上1-5的驗(yàn)證,銅死亡的機(jī)制已揭曉:銅離子載體誘導(dǎo)細(xì)胞內(nèi)銅離子水平上升至超過閾值,過量的銅促進(jìn)硫辛酰化蛋白聚集,并使Fe-S簇蛋白不穩(wěn)定,導(dǎo)致細(xì)胞蛋白毒性應(yīng)激增高,最后誘導(dǎo)細(xì)胞死亡。但是,團(tuán)隊(duì)再次提出疑問:銅離子載體誘導(dǎo)的細(xì)胞死亡與自然發(fā)生的銅穩(wěn)態(tài)功能障礙是否是同一種分子機(jī)制導(dǎo)致?
為探索其潛在聯(lián)系,研究者首先在人胚胎腎HEK 293T和ABC1細(xì)胞中過表達(dá)銅運(yùn)載體SLC31A1(銅穩(wěn)態(tài)的關(guān)鍵靶點(diǎn)),數(shù)據(jù)表明,銅輸入顯著增強(qiáng)了細(xì)胞對(duì)線粒體呼吸相關(guān)蛋白的總消耗,導(dǎo)致蛋白硫辛?;瘻p少,F(xiàn)e-S簇蛋白水平降低,HSP70應(yīng)激蛋白水平升高。
更值得關(guān)注的是,過表達(dá)SLC31A1的細(xì)胞中,鐵死亡、壞死性凋亡、凋亡抑制劑和抗氧化劑,均都不能阻止銅誘導(dǎo)的細(xì)胞死亡,但銅螯合劑、FDX1 Knockdown和LIAS Knockdown卻可以減輕細(xì)胞死亡現(xiàn)象。
最后,研究者采用Wilson's disease小鼠模型發(fā)現(xiàn),老年Atp7b缺陷小鼠的肝臟中,蛋白的硫辛?;胶虵e-S簇蛋白的含量,均顯著降低,Hsp70蛋白則升高。通過多種模型分析,基因誘導(dǎo)下的銅過量導(dǎo)致的細(xì)胞死亡機(jī)制與銅離子載體誘導(dǎo)的細(xì)胞死亡機(jī)制是同一種機(jī)制。
圖6. 銅過量導(dǎo)致的細(xì)胞死亡機(jī)制與銅離子載體誘導(dǎo)的細(xì)胞死亡機(jī)制是同一種機(jī)制 [1]
3.“銅死亡”相關(guān)熱門靶點(diǎn)
目前該研究中,作者主要發(fā)現(xiàn)了多個(gè)與“銅死亡”代謝途徑特異性相關(guān)的調(diào)節(jié)基因。這些關(guān)鍵調(diào)節(jié)因子在“銅死亡”過程中的具體作用,以及銅毒性治療癌癥的有效性將是未來的研究熱點(diǎn)。
華美生物匯總了當(dāng)前與“銅死亡”相關(guān)信號(hào)通路中,大部分熱門靶點(diǎn)抗體產(chǎn)品,點(diǎn)擊靶點(diǎn)對(duì)應(yīng)貨號(hào)可查看相關(guān)試劑(具體詳情見下表)。
“銅死亡”熱門靶點(diǎn)抗體產(chǎn)品匯總:
信號(hào)通路 | 調(diào)控方式 | 關(guān)鍵靶點(diǎn) | 貨號(hào) | 宿主 | 反應(yīng)種屬 | 適用應(yīng)用 |
---|---|---|---|---|---|---|
硫辛酰途徑 | 正調(diào)控 | DLD | CSB-PA006928LA01HU | Rabbit | Human, Mouse, Rat | ELISA, WB, IHC |
CSB-PA783949 | Rabbit | Human, Mouse, Rat | ELISA, IHC | |||
DLAT | CSB-PA006926LA01HU | Rabbit | Human | ELISA, WB, IP | ||
CSB-PA445587 | Rabbit | Human, Mouse, Rat | ELISA, WB, IHC | |||
丙酮酸脫氫酶(PDH)復(fù)合物體途徑 | LIAS | CSB-PA012927LA01HU | Rabbit | Human | ELISA, WB, IHC | |
PDHA1 | CSB-PA017715LA01HU | Rabbit | Human | ELISA, IHC, IF | ||
CSB-PA247984 | Rabbit | Human | ELISA, WB, IHC | |||
PDHB | CSB-PA017717ESR2HU | Rabbit | Human | ELISA, IHC | ||
CSB-PA017717GA01HU | Human, Mouse, Rat | Rabbit | ELISA, WB, IHC | |||
負(fù)調(diào)控 | GLS(GAM/GAC/KGA) | CSB-PA009528DA01HU | Human, Mouse | Rabbit | ELISA, WB, IHC | |
CSB-PA969762 | Human, Mouse, Rat | Rabbit | ELISA, WB, IHC | |||
CSB-PA177709 | Human, Mouse, Rat | Rabbit | ELISA, IHC | |||
MTF1 | CSB-PA013754LA01HU | Human | Rabbit | ELISA, WB, IHC, IF | ||
P16-INK4A(CDKN2A) | CSB-PA005089LA01HU | Human | Rabbit | ELISA, IHC | ||
CSB-PA003618 | Human, Mouse | Rabbit | WB, ELISA | |||
甘氨酸裂解酶系統(tǒng)(GCS)系統(tǒng)途徑 | / | GCSH | CSB-PA009335GA01HU | Human, Mouse, Rat | Rabbit | ELISA, WB, IHC, IF |
參考文獻(xiàn):
1. Tsvetkov, Peter, et al. "Copper induces cell death by targeting lipoylated TCA cycle proteins." Science 375.6586 (2022): 1254-1261.