​新型冠狀病毒導致的新型冠狀病毒肺炎是當前全球關(guān)注的公共健康問題。新型冠狀病毒（SARS-CoV-2）不僅傳播迅速，而且具有致命性。截至2020年6月7日，新型冠狀病毒已經(jīng)感染超過700萬人，并奪走了超過40萬人的生命。

 

 

2020年4月3日，《紐約時報》著名專欄作家Carl Zimmer和《紐約時報》科學圖形編輯Jonathan Corum發(fā)表了題為"Bad News Wrapped in Protein: Inside the Coronavirus Genome" 的文章。該文章將SARS-CoV-2編碼的29種蛋白以模式圖和簡明易懂的文字呈現(xiàn)出來。

病毒必須感染進入活細胞才能進行復制和傳播。當SARS-CoV-2病毒找到合適的細胞時，它會注入一條包含整個基因組的RNA鏈。SARS-CoV-2病毒的基因組不到30000個堿基，研究學者已經(jīng)鑒定出基因組能夠轉(zhuǎn)錄多達29種蛋白質(zhì)。為學者們對其他冠狀病毒的研究提供了了解SARS-CoV-2蛋白的途徑。

 

SARS-CoV-2的基因組分為非結(jié)構(gòu)基因和結(jié)構(gòu)基因兩個部分。其中約占SARS-CoV-2全基因組總長度三分之二的非結(jié)構(gòu)基因含有兩段編碼蛋白質(zhì)的序列，稱為ORF1a和ORF1b；而緊隨其后的結(jié)構(gòu)基因區(qū)域則編碼S(Spike)、E、M、N結(jié)構(gòu)蛋白。

 

（圖1：SARS-CoV-2的29種蛋白質(zhì)）

結(jié)構(gòu)蛋白

 

 

 

冠狀病毒結(jié)構(gòu)基因組依次編碼刺突蛋白(Spike protein)、包膜蛋白(Envelope protein)、膜蛋白(Membrane protein)和核衣殼蛋白(Nucleocapsid)。

（圖2：SARS-CoV-2 Structure）

 

 

 

刺突蛋白(S 蛋白)承擔病毒與宿主細胞膜受體結(jié)合及膜融合功能，是宿主中和抗體的重要作用位點以及疫苗設(shè)計的關(guān)鍵靶點。2019-nCoV 的Spike蛋白與人ACE2互作來感染人的呼吸道上皮細胞。

包膜蛋白(E蛋白)和膜蛋白(M蛋白)是冠狀病毒高效組裝的關(guān)鍵。

E蛋白

M蛋白參與病毒包膜的形成和出芽過程，即參與病毒的組裝和病毒釋放，抑制IFN攻擊。兩者可用于檢測抗體。

 

核衣殼蛋白(N 蛋白)是冠狀病毒中含量最豐富的蛋白。在病毒體組裝過程中，N蛋白與病毒RNA結(jié)合并導致螺旋核衣殼的形成。可以利用N蛋白建立快速檢測2019-nCoV血清抗體方法，也可以進一步制備單抗或開展解析該蛋白結(jié)構(gòu)等研究。

非結(jié)構(gòu)蛋白

 

SARS-CoV-2是一種正鏈RNA病毒，它的復制是由病毒非結(jié)構(gòu)蛋白（nsp）的多亞基復制/轉(zhuǎn)錄復合物介導的。

SARS-CoV-2非結(jié)構(gòu)基因中有兩個大的重疊開放閱讀框(ORF)，分別是ORF1a和ORF1b。每個都有一個Orf1ab編碼16個預測的Nsps（如圖1），主要是負責編碼與病毒復制、轉(zhuǎn)錄相關(guān)的酶。

 

 

取消標記和切割蛋白·NSP3

NSP3是一種具有兩個重要功能的蛋白質(zhì)，一是切割其他病毒蛋白，以便行使各自的功能。它還會改變許多被感染細胞的蛋白質(zhì)。通常健康的細胞會標記舊蛋白質(zhì)以進行降解。但是SARS-CoV-2病毒可以去除這些標簽，改變蛋白質(zhì)的平衡，降低細胞抵抗病毒的能力。

 

 

 

蛋白質(zhì)剪刀·NSP5

這種蛋白質(zhì)可以使大多數(shù)其他NSP蛋白質(zhì)從蛋白鏈上解放出來。

細胞中心·NSP9

這種蛋白質(zhì)會通過微小通道滲入被感染細胞的核中，它可能能夠影響分子進出核的運動——但是出于什么目的，還未知。

 

 

 

 

華美生物新冠非結(jié)構(gòu)蛋白產(chǎn)品

 

非結(jié)構(gòu)蛋白nsp3

 

Recombinant Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 Non-structural protein 3(nsp3),partial（CSB-EP3398GND）

蛋白來源：E.coli

蛋白標簽：N-terminal 10xHis-tagged
蛋白純度：Greater than 90% as determined by SDS-PAGE.

 

Tris-Glycine gel) Discontinuous SDS-PAGE (reduced) with 5% enrichment gel and 15% separation gel.

 

 

 

 

 

非結(jié)構(gòu)蛋白nsp5

 

Recombinant Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 3C-like proteinase(NSP5) （CSB-EP3389GND）

蛋白來源：E.coli

蛋白標簽：N-terminal 10xHis-tagged
蛋白純度：Greater than 90% as determined by SDS-PAGE.

(Tris-Glycine gel) Discontinuous SDS-PAGE (reduced) with 5% enrichment gel and 15% separation gel.

 

非結(jié)構(gòu)蛋白nsp9

 

Recombinant Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 Non-structural protein 9(nsp9) （CSB-MP3388GND）

蛋白來源：Mammalian cell

蛋白標簽：C-terminal hFC-Flag-tagged
蛋白純度：Greater than 90% as determined by SDS-PAGE.

Tris-Glycine gel) Discontinuous SDS-PAGE (reduced) with 5% enrichment gel and 15% separation gel.

 

 

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本文部分信息來源：

https://www.nytimes.com/interactive/2020/04/03/science/coronavirus-genome-bad-news-wrapped-in-protein.html

 

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